Pour comparer deux nuages de points homologues, la méthode de référence est l'analyse procrustéenne et, dans le cas de plus de deux nuages, l'Analyse Procrustéenne Généralisée (APG). L'Analyse Factorielle Multiple (AFM) fournit aussi une représentation superposée de nuages de points homologues. Cette dernière représentation bénéficie, par rapport à celle issue de l'APG, d'avantages (elle s'inscrit dans le cadre d'une analyse factorielle riche en aides à l'interprétation) et d'inconvénients (les nuages à comparer subissent des déformations autres que les seules projections et rotations). Il est possible de compléter l'AFM par un ajustement procrustéen de chacun des nuages initiaux sur le nuage moyen de l'AFM. On obtient ainsi une représentation de ces nuages qui à la fois respecte le modèle procrustéen et s'inscrit dans le cadre de l'AFM. Cette nouvelle représentation est précieuse lorsque les nuages initiaux sont bidimensionnels. Une application dans ce cas particulier est présentée.