Cet article décrit le projet MEAT (Mémoire d'Expériences pour l'Analyse du Transcriptome) dont le but est d'assister les biologistes travaillant dans le domaine des puces à ADN, pour l'interprétation et la validation de leurs résultats. Nous proposons une aide méthodologique et logicielle pour construire une mémoire d'expériences pour ce domaine. Notre approche, basée sur les technologies du web sémantique, repose sur l'utilisation des ontologies et des annotations sémantiques sur des articles scientifiques et d'autres sources de connaissances du domaine. Notre approche peut être généralisée à d'autres domaines requérant des expérimentations et traitant un grand flux de données (protéomique, chimie,etc.).