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RNTI

MODULAD
Recherche adaptative de structures de régulation génétique
In EGC 2008, vol. RNTI-E-11, pp.427-432
Résumé
Nous avons proposé un algorithme original de Fouille de Données, LICORN, afin d'inférer des relations de régulation coopérative à partir de données d'expression. LICORN donne de bons résultats s'il est appliqué à des données de levure, mais le passage à l'échelle sur des données plus complexes (e.g., humaines) est difficile. Dans cet article, nous proposons une extension de LICORN afin qu'il puisse gérer une contrainte de co-régulation adaptative. Une évaluation préliminaire sur des données de transcriptome de tumeurs de vessie montre que les réseaux significatifs sont obtenus à l'aide d'une contrainte de corégulation adaptative de manière beaucoup plus efficace, et qu'ils ont des performances de prédiction équivalentes voire meilleures que celles obtenues par LICORN.