Les acteurs et usagers du domaine médical (médecins, infirmiers, patients, internes, pharmaciens, etc.) ne sont pas issus de la même catégorie socioprofessionnelle et ne présentent pas le même niveau de maîtrise du domaine. Leurs écrits en témoignent et véhiculent, de plus, la subjectivité qui leur est propre. Nous nous intéressons à l'étude automatisée de la subjectivité dans le discours médical dans des textes en langue française. Nous confrontons le discours des médecins (articles scientifiques, rapports cliniques) à celui des patients (messages de forums de santé) en analysant contrastivement les différences d'emploi des descripteurs tels que les marqueurs d'incertitude et de polarité, les marques émotives non lexicales (smileys, ponctuations répétées, etc.) et lexicales, et les termes médicaux relatifs aux pathologies, traitements et procédures. Nous effectuons une annotation et catégorisation automatiques des documents afin de mieux observer les spécificités que présentent les discours médicaux ciblés.