Ces dernières années, les progrès en informatique et en imagerie numérique ont fait émerger une nouvelle discipline, la chirurgie assistée par ordinateur. Les systèmes de chirurgie assistée par ordinateur contribuent à l'amélioration du déroulement des procédures chirurgicales. Un des objectif à long terme de nos travaux est de proposer des solutions d'amélioration de ces systèmes, basées sur les connaissances du chirurgien quant au déroulement de la procédure, par l'utilisation d'un modèle générique qui permet de capturer et de représenter ces connaissances. Cet article présente une méthodologie d'exploitation d'un ensemble de cas chirurgicaux décrits à l'aide de ce modèle générique, par des algorithmes issus de l'extraction de connaissance à partir de données, afin de mettre en évidence des invariants dans les descriptions structurées du déroulement des cas chirurgicaux. Il détaille en outre les difficultés rencontrées de par notamment le caractère complexe des données étudiées.