Nous présentons ici un système d'extraction et d'identification d'entités nommées complexes à l'intention des corpus de spécialité biomédicale. Nous avons développé une méthode qui repose sur une approche mixte à base d'ensemble de règles a priori et de dictionnaires contrôlés. Cet article expose les techniques que nous avons mises en place pour éviter ou minimiser les problèmes de synonymie, de variabilité des termes et pour limiter la présence de noms ambigus. Nous décrivons l'intégration de ces méthodes au sein du processus de reconnaissance des entités nommées. L'intérêt de cet outil réside dans la complexité et l'hétérogénéité des entités extraites. Cette méthode ne se limite pas à la détection des noms des gènes ou des protéines, mais s'adapte à d'autres descripteurs biomédicaux. Nous avons expérimenté cette approche en mesurant les performances obtenues sur le corpus de référence GENIA.