Cet article présente l'approche que nous avons adoptée pour résoudre le problème d'intégration de données dans le contexte du projet SIC-Sénégal dont l‘objectif est de permettre à plusieurs organismes partenaires de partager leurs sources de données environnementales. Nous réalisons une intégration en deux phases. Une première phase d'intégration structurelle, basée sur l'utilisation d'entrepôts de documents XML, permet de créer un entrepôt pour chaque organisme participant au projet. Une deuxième phase consiste alors à effectuer l'intégration de ces entrepôts de documents XML en associant une ontologie à chaque entrepôt. Cela se fait par une construction automatique d'ontologie OWL à partir des données XML de l'entrepôt et par une réutilisation de l'ontologie AGROVOC.