Après avoir donné en analyse de variance et covariance une définition précise des effets, indépendant des données recueillies, on montre l'impact de la non orthogonalité sur la précision d'estimation de ces effets. Des emples illustrant la nécessité dans le cas non orthogonal d'étudier des combinaisons linéaires de ces effets, déterminées à posteriori en fonction des données recueillies. Une technique d'obtention de fonctions estimables "simples" est aussi proposée.